Интересно, что в истории Геническа казачество появилось издревле. Согласно летописям еще в 860 году в северо-западное Приазовье пришли касаки, которые обратились к находившимся здесь славянским просветителям Кириллу и Мефодию и приняли христианство. В дальнейшем в истории Геническа казаки упоминаются, как охрана купеческих караванов и гарнизоны сторожевых постов и укреплений. После турецкой агрессии на полуостров и его исламизации, казаки Приазовья ушли на Днепр или на Дон.С этого периода казаки совершают постоянные набеги на крепость, отбивая захваченных татарами и турками христианских пленников. В 1736 году казаки атамана Ивана Малашевича в составе войск русского полководца Миниха захватили Геническ и построили тут шанцы — земляные укрепления, включающие в себя окопы в полный рост, окопы в полу рост с земляным бруствером, хода сообщения, землянки, а также редуты — земляные валы для артиллерийских орудий. Казачий гарнизон удерживал город до 1739 года. В 1769 году казаки отряда Петровской крепости на Днепре во главе с атаманом Михаилом Стогайлом захватили Геническую крепость, чем не допустили татар на Сечь. С этого времени крепость Геничи оставалась во власти казаков до 1771 года, когда татары отбили ее. Однако отряд атамана Щербатого штурмом овладел крепостью снова, чем помог отряду Опанаса Ковпака переправиться через Сиваш в тыл татарам и захватить Перекоп. Гнали татар до Феодосии, а там русские войска штурмом взяли ее. Затем, развернувшись, штурмовали крепость Арабат. После 1771 казачий гарнизон остался в Геническе постоянно. После ликвидации Запорожской Сечи в 1775 году все казачьи полки и отряды подчинили командующему крымской группой войск генералу Александру Суворову. Под его руководством перестраивалась крепость в Геническе, оборудовались артиллерийские бастионы в сторону моря, укреплялись и выкапывались новые арсеналы и казематы. Казаки местного гарнизона помогали местным грекам восстанавливать разрушенные турками церкви и монастырь.
Именно из Геническа вышли казачьи отряды, которые подавили восстание татар, устроенное турками, и «препроводили» членов татарского правительства на Белую скалу, где им было объявлено о необходимости подписать договор о «Добровольном присоединении Крыма к России». Так генические казаки поучаствовали в присоединении Крыма к России. До 1788 года в крепостях Геническ и Арабат оставалось по две сотни казаков с артиллерией.
Казаки Азовского казачьего полка отличились в Отечественной войне 1812 года, а затем брали Париж в 1814 -1815 годах. Летописцы сообщали, что вокруг Геническа находят старые казачьи захоронения.
На сегодняшний день в Геническе находится курень Усть-Азовского отдельного казачьего полка.